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Bando Progetto AGER (feb_2014)

Assegno di Ricerca

Protocollo: 57 del 17/02/2014

Pubblicato il: 19/02/2014

Scadenza presentazione domande: 11/03/2014 - 12:00

Aggiornamento del 24/03/2014 - 09:00: Pubblicato l'esito finale del Bando

Analisi della variabilità nel genoma di suini di razza Large White e associazione con caratteri produttivi mediante tecniche innovative di sequenziamento e di analisi del genotipo

L’assegno di ricerca si inserisce nell’ambito del progetto AGER “Advanced research in genomics and processing technologies for the Italian heavy pig production chain – Hepiget” che mira all’identificazione di marcatori del DNA associati con caratteri produttivi nei suini pesanti italiani.

L’attività dei due assegni di ricerca sarà effettuata presso il Dipartimento di Scienze e Tecnologie Agro-Alimentari con sede a Bologna e sarà focalizzata:

  • Sull’utilizzo di tecniche per analisi Genome Wide per caratteristiche qualitative della carne con particolare riferimento alla deposizione di grasso nella carne, alla composizione in acidi grassi e altri parametri tecnologici della carne rilevati in suini di razza Large White;
  • Sull’analisi delle correlazioni tra questi parametri e analisi della ereditabilità di questi caratteri;
  • Sulla validazione dei risultati delle analisi Genome wide con genotipizzazione di marcatori scelti nei suini Large White utilizzati per il progetto AGER;
  • Sull’utilizzo di tecniche di Next Generation Sequencing per il risequenziamento del genoma di suini di razza Large White;
  • Sull’analisi dei dati di sequenziamento per l’identificazione di polimorfismi del DNA quali single nucleotide polymorphisms (SNP) e copy number variation (CNV);
  • Sull’utilizzo di tecniche di high throughput genotyping per la genotipizzazione di SNP;
  • Sull’identificazione e analisi di marcatori del DNA in geni candidati per caratteristiche produttive.

I dati saranno elaborati per identificare i geni coinvolti nelle regioni interessate da polimorfismi del DNA e variazioni strutturali con particolare riferimento ai CNV. L’identificazione di SNP nel genome suino applicando diversi sistemi e procedure per la gestione delle informazioni di sequenza. Sarà uno dei gli obiettivi delle ricerche programmate per l’attività dei due assegnisti. Per gli studi di associazione tra marcatori identificati e caratteri produttivi verranno utilizzati gli SNP e i polimorfismi e dati fenotipici e genetici già disponibili su circa 900 suini di razza Large White.

Il progetto permetterà di acquisire conoscenze specialistiche nell’ambito dello studio della variabilità del genoma nella specie suina e nell’identificazione di marcatori associati con caratteri produttivi di interesse economico. Lo studio della letteratura specifica del settore rappresenterà la base formativa del progetto.

Archivio Bandi

Contatti

Roberta Davoli

Professoressa ordinaria

Dipartimento di Scienze e Tecnologie Agro-Alimentari

Via F.lli Rosselli 107-Coviolo

Reggio Emilia (RE)

tel: +39 051 20 9 6024